Cell | 染色质激活或抑制状态决定了核小体分离出来的差异性

2021-10-13 17:18:17 来源:
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肝细胞骨架通过促进或诱导该骨架的转录可以掌控等位基因组的特性和细胞身份推定。这些肝细胞骨架中则会发挥作用特定的基因突变物质译者后词句(posttranslational modifications,PTMs),它们与特定转录状况涉及,并可促进诱导性染色体骨架的呈现出,因素等位基因的暗示。为了在增生时依然保持等位基因暗示程序的正确性,不得不肝细胞骨架的大分子特征也只能在子代细胞中则会建立。建立有所不同类DF肝细胞状况的举足轻重不得不因素是基因突变物质PTMs,;大要发挥作用于基因突变物质H3和H4的爪子上。因此,在增生的过程中则会,除了DNA克隆,表型核小体也只能重建,并更进一步分配到子代细胞中则会。确实,数据分析找到表型的当代基因突变物质(比如克隆依赖的基因突变物质)则会在克隆长柄后迅速更进一步组装。有所不同的数据分析组找到H3K9me3和H3K27me2/3可通过细胞分裂基因突变。然而,这两个基因突变物质词句都是与诱导性肝细胞骨架涉及。那么,表型中则会的核小体,以及它们携带的基因突变物质PTMs是否都能基因突变到子代细胞两者之间近的等位基因正中央上呢?来自宾夕法尼亚大学兰戈恩医学中则会心的Danny Reinberg教授课题组在Cell发表数据分析Active and Repressed Chromatin Domains Exhibit Distinct Nucleosome Segregation during DNA Replication,该数据分析找到在DNA克隆时,启动时与深受诱导肝细胞范围的核小体分立是有所不同的。深受诱导肝细胞骨架中则会的核小体则会被并建在子代细胞两者之间近的等位基因范围,而启动时DF肝细胞骨架中则会的核小体的更进一步分配则是发散和随机的。为数据分析核小体的分立情形,数据分析者在候选等位基因正中央不可逆的标上基因突变物质H3.1和H3.2,以跟踪小鼠胚胎发育造血中则会核小体在增生时的变化。简单来说,该分析方法通过中心地带受体标上技术,利用CRISPR为特定等位基因正中央的H3.1和H3.2丢下半乳糖标上,经ChIP-qPCR样品该半乳糖标上在有丝分裂G1期和S期的数量级,以催化核小体的分立情形。若该位点H3.1和H3.2上的半乳糖标上在一次增生后下降一半,所述该核小体被并建在了两个子代细胞的两者之间近等位基因正中央上;若该半乳糖词句立刻消失,所述子代细胞并未基因突变该等位基因正中央的核小体。数据分析者首先样品了在胚胎发育造血中则会沉默暗示的Hoxc6, Ebf1, Meis2等位基因的核小体分立情形。这些等位基因正中央的核小体半乳糖水平随增生逐渐减半,这提示深受诱导的等位基因正中央的核小体则会被并建在子代细胞的两者之间近后方。这与前人找到的H3K9me3和H3K27me2/3可通过细胞分裂基因突变的现象两者之间印证。那么,启动时DF肝细胞范围的核小体又是如何分立的呢?数据分析者样品了在胚胎发育造血中则会被启动时暗示的Ccna2, Nanog和Pou5f1等位基因,找到该等位基因正中央的半乳糖标上在增生后呈发散状况,数量级很低,这提示对于启动时DF肝细胞范围来说,表型核小体没粗略的更进一步分配到子代细胞两者之间应的等位基因正中央,而是随机更进一步分配的。非;也有趣的是,在正向胚胎发育造血分化时,Hoxc6等位基因由诱导转回启动时,它的核小体更进一步分配模式也由粗略的同位点更进一步分配改为随机更进一步分配。这所述表型核小体的局部更进一步分配,可以反映该肝细胞范围的活性状况。总的来说,该数据分析通过CRISPR引导的基因突变物质半乳糖标上系统,数据分析了核小体在增生过程中则会的更进一步分配模式,并找到启动时与深受诱导的肝细胞范围的核小体更进一步分配模式的有所不同。值得注意的是,在有丝分裂的S前所则会,深受诱导的肝细胞范围的克隆要晚于启动时DF肝细胞范围。这个整整差异色也致使;也肝细胞的克隆速率成比例异色肝细胞。异色肝细胞两者之间对较慢的克隆速度或许保证了核小体的粗略更进一步分配,而;也肝细胞中则会的PTMs则由两者之间应的;大适度因子(master regulators)直接标记两者之间应DNA序列,并招募PTMs酶更进一步建立。原始出处:Escobar TM1, Oksuz O1, Salda?a-Meyer R1, et al.Active and Repressed Chromatin Domains Exhibit Distinct Nucleosome Segregation during DNA Replication.Cell. 2019 Oct 31;179(4):953-963.e11. doi: 10.1016/j.cell.2019.10.009.
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