Nat Biotechnol:研究不能每一次?可能是HeLa细胞系“变”了

2021-12-13 05:24:39 来源:
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HeLa巨噬细胞已经在亚洲地区的许多研究室养成了近70年,并且长期以来被相信是无限用电的基本的相近巨噬细胞。然而,2年末18日发表在《Nature Biotechnology》杂志上的一项新相比较,巨噬细胞在各不相近研究室两者之间发挥作用很大关联,这随之而来了对巨噬细胞;也分析复杂性的质疑。“我很高兴看到这项分析,但在某种普遍性上我不一定感觉到惊讶,”斯隆瑞德琳胃癌中所心的底物生态学家Prasad Jallepalli说,他没有参与这项分析。这不一定是HeLa巨噬细胞;也自诞生以来第一次出现独有的报道:多年来,其他分析工作组也证明HeLa巨噬细胞相异锥体两者之间在DNA和RNA表述的显着关联。这项不断格外新分析首次全面分析了各种HeLa相异锥体的表现型相异(各不相近种产品的HeLa巨噬细胞;也境遇在亚洲地区的各个研究室),并且首次证明表现型异质性造成了了核糖体表述和特异性的推移。HeLa巨噬细胞“衰了”?在这项分析中所,分析职员从6个国际组织的13个研究室收集了14份HeLa样本,并在相近的研究室必需下进行时养成。他们首先量化了基因拷贝数相异,阐明了它们基因组两者之间的显着关联。结果注意到,HeLa相异锥体两者之间,尤其是CCL2和Kyoto相异锥体两者之间发挥作用着非常大的异质性。再进一步的相比较,许多这些表现型关联转化为mRNA产生的推移,并且在相当大层面上转化为核糖体丰度的推移。分析职员报告说,HeLa CCL2和Kyoto巨噬细胞;也的转录组和核糖体组谱彼此两者之间的关联,就像来自两种各不相近类型组织的骨髓;也两者之间的关联一样。HeLa相异锥体在养成格外进一步中所生长低速也各不相近,一些巨噬细胞一组需要17.5全程才能翻倍,而另一些巨噬细胞在相近的养成必需下需要话费超过32全程。它们对沙门氏菌病毒感染的反应也有所各不相近:与其他两种衰锥体相比,一种衰锥体对病毒感染的敏感性较低,分析职员将其归咎于低水平的核糖体核酸,这种核糖体核酸在细菌转回消化道巨噬细胞中所起发挥作用。在一项原则上的科学研究中所,分析工作组通过养成巨噬细胞;也三个年末,来观察HeLa相异锥体的基因表述到底但会随着星期不定。分析职员就有了20世纪巨噬细胞和后期巨噬细胞两者之间基因表述关联左右6%。苏黎世的政府理工学院底物;也统生态学分析所的Ruedi Aebersell教授是该分析的合着者,他说,“即使在同一个研究室里,这些巨噬细胞的关联和推移低速也是非常极好的。”他估计,如果一个分析生在工程项目开始时用HeLa巨噬细胞;也做了一个科学研究,并在六个年末后被要求重复这个科学研究,他们不必要得到各不相近的结果。关于分析中所的“可脱氧核糖核酸性恐慌”的讨论大多数集中所在系统性、数据分析方面的缺陷,以及作为主要传动装置因素的受污染或贴错标识的巨噬细胞;也。但是Aebersell相信,HeLa巨噬细胞;也和骨髓;也的生态学关联也许是关键。为什么但会“衰”?斯坦福大学的巨噬细胞生态学家Tim Stearns相信有几个也许的原因可以暗示为什么巨噬细胞;也在短星期内养成下但会不定。首先,HeLa巨噬细胞是目前为止基因组不稳定的骨髓,因此很也许随星期随机突衰。此外,它们还但会在研究室中所受到各种生长必需的制约,这不必要促使巨噬细胞进化出截然不同的特点。例如,他说,类动物巨噬细胞的养成包括将其养成到充满一个养成基为止,从养成基中所抽取一部分巨噬细胞,然后将它们放在另一个养成基中所生长,这一格外进一步称为分离。“每个人做这件事的方式都看起来各不相近,”他说道。不断格外新这些注意到,对于人类养成巨噬细胞的分析结果的暗示和重演性有一定的普遍性。Aebersell和他的同事在论文中所提出了几个具锥体的解决方案。首先,分析职员某种层面应用于骨髓;也的20世纪传代,并必需在同一巨噬细胞;也的各不相近样本中所重复同一巨噬细胞;也的科学研究。格外不可或缺的是,生态学家某种层面清楚地报告他们在给定的分析中所应用于的巨噬细胞;也相异锥体。
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